Aunque la cerveza es restrictiva para el crecimiento bacteriano debido a su bajo pH, su concentración de etanol y su bajo contenido de oxígeno, la presencia de determinadas bacterias que alteran la cerveza —entre ellas, Lactobacillus, Pediococcus, Pectinatus y Megasphaera— puede generar sabores desagradables, turbidez y acidez. Tales deficiencias de calidad hacen que el producto sea inaceptable y con frecuencia ocasionan altas pérdidas económicas y una imagen negativa de la marca. Durante todo el proceso de producción, debe prevenirse la contaminación microbiana indeseada para lograr la calidad final necesaria de la cerveza. Esta contaminación puede originarse a causa de ingredientes (incluida la levadura), servicios de aire y agua que entran en contacto con el producto, y el ambiente.

El agua de manantial es un recurso natural valioso, que exige un buen tratamiento de purificación antes de aparecer en las góndolas de las tiendas como un producto embotellado de alta pureza y agradable a la vista. La filtración es un paso clave del proceso necesario para lograr una calidad del producto consistentemente alta. Los costos asociados a la filtración pueden ser considerables, según la calidad del agua de origen. Los filtros desechables son una solución técnica sólida, pero su uso puede volverse insostenible desde el punto de vista económico debido a la escasez de fuentes de agua y su calidad variable.

La salazón por inmersión en salmuera se usa para muchas variedades de queso en todo el mundo. Durante las inmersiones repetidas, la grasa, las partículas de cuajada y los microorganismos del queso, más la acumulación de proteínas y otros componentes, se acumulan en un entorno rico en nutrientes para los microorganismos resistentes a la sal. Así, la salmuera reutilizada puede convertirse en un reservorio de microorganismos no deseados, como las bacterias que producen gases o pigmentos, la levadura y el moho, o los patógenos resistentes a la sal, que contaminan el queso y afectan su calidad. Un buen control de la salmuera y su operación es esencial para garantizar una producción diaria consistente. La eliminación de la salmuera también atrae cada vez más atención. Los costos elevados de eliminación o las limitaciones de volumen en áreas específicas impulsan la demanda de una mayor utilización de la salmuera, a fin de generar ahorros de costos operativos y minimizar la huella medioambiental de la planta.

La filtración de bebidas alcohólicas puede ser una tarea difícil. Es fundamental eliminar los contaminantes que pueden causar turbidez y conservar los componentes que mejoran la calidad del producto. Las placas filtrantes son el método tradicional para lograr este delicado equilibrio. Las placas están compuestas de una exclusiva matriz de materiales que proporcionan una excelente combinación de adsorción y filtración de profundidad, por lo que son una solución ideal para la reducción de la turbidez y la remoción de la opacidad en las bebidas alcohólicas. Las placas filtrantes están disponibles en múltiples grados, para cubrir una amplia gama de aplicaciones, desde la filtración de concentrados hasta la reducción de la turbidez fría en las bebidas alcohólicas de colores oscuros y la remoción de partículas en las bebidas destiladas de colores claros. Además, muchas unidades de filtro con placas y marcos tienen la flexibilidad para añadir o quitar placas según el tamaño del lote, la velocidad de flujo o el producto específico que se debe filtrar.

Los productores de ingredientes para alimentos y forraje a granel, como aminoácidos, ácidos orgánicos y vitaminas, usan la fermentación como base de su producción. Los procesos industriales biotecnológicos modernos de la actualidad usan cultivos celulares microbianos cuidadosamente seleccionados y purificados, a fin de producir una variedad cada vez mayor de ingredientes y aumentar la productividad. Durante la fermentación, los microorganismos se multiplican en biorreactores industriales, utilizando una fuente de carbohidratos como energía. El crecimiento microbiano progresa en condiciones muy controladas de aireación, velocidad de agitación, temperatura, pH y otros parámetros. La fermentación puede durar de un par de horas a varios días. Los productos finales metabólicos producidos por los microorganismos son la base de muchos ingredientes que usamos en la actualidad.

La filtración es una operación clave en la producción moderna de sidra para poder brindar un producto que permanezca estable y brillante en anaqueles. Tradicionalmente, la clarificación de sidra se ha llevado a cabo con tecnología basada en placas o tierra de diatomeas. No obstante, con una mayor rentabilidad, operación más sencilla y volúmenes más bajos de desperdicio, los sistemas de filtración de flujo tangencial como el sistema Oenoflow XL de Pall se han hecho más populares en el transcurso de la última década.

El té listo para beber, los jugos y las bebidas de frutas, las bebidas carbonatadas, entre otras, están sujetas a alteraciones debido a la presencia de TAB (esporas bacterianas acidofílicas) resistentes al calor. Las esporas termoacidofílicas pueden originarse debido a la exposición a la materia prima agrícola, como en la producción de jugo de frutas, o debido a la contaminación en los ingredientes de la bebida, como los edulcorantes, el jugo o té concentrados, o los saborizantes, las esencias y los colorantes de los extractos naturales.